History
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Focus issues: see doc/how-to-get-focus-right.txt

Keep panel always on top: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=81551
Edge flipping: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=82917
Opaque resize: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=92618
Alt+click to move/resize: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=101151
minimized windows in Alt+tab: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=89416
dialogs above entire app group: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=88926

display window size/position: 
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=85213
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=106645
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=130821

configure click actions, alt+click:
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=83210

system modal dialogs: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=83357

workspace wrapping: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=89315

raise windows on click:
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=86108
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=115072
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=115753

Tracking bugs
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session management: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=107063

revise theme format: http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=102547

bugs in focus-stealing-prevention: 
  http://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=149028